Os elementos nutricionais, sobretudo proteínas, carboidratos, vitaminas e minerais contidos no leite, transformam-no em um excelente substrato para o crescimento de micro-organismos. Por este motivo, o leite deve ser obtido com razoável higiene e altas temperaturas, visando garantir características em todas as etapas do processo até a chegada ao produto final.

Até julho de 2005, o leite utilizado na elaboração de derivados, exceto o leite UHT, seguia as mesmas normas estabelecidas para o leite tipo A produzido em granjas leiteiras, recolhido por caminhões e transportado até a usina de beneficiamento. Entretanto, esse modelo sofreu uma profunda revisão a partir do início da década de 1990, por meio da qual as indústrias passaram a exigir melhor qualidade de leite.

Pode-se enumerar três fatores principais relacionados à qualidade microbiológica do leite, determinando, inclusive, o prazo de sua vida útil; são eles: condições de higiene na ordenha, temperatura do leite após a ordenha e durante o transporte até a usina.

O tratamento das mastites não representa grandes implicações na saúde pública. Os valores de CCS estão diretamente relacionados com o aumento da contagem de bactérias psicrófilas do leite. Sendo que quanto melhor a desinfecção dos tetos, mais baixa a CCS e menor a concentração de bactérias psicrófilas no leite produzido.