O SISVAN tem como finalidade principal a elaboração de recomendações alimentares individualizadas, sendo executado prioritariamente em nível hospitalar para acompanhamento clínico especializado. 

O SISVAN constitui instrumento estratégico da Política Nacional de Alimentação e Nutrição, destinado ao monitoramento do estado nutricional e do consumo alimentar da população usuária do SUS, subsidiando o planejamento e a avaliação das ações em saúde.

O monitoramento realizado pelo SISVAN restringe-se à população infantil, sendo os demais ciclos de vida acompanhados por sistemas específicos. 

A avaliação antropométrica no âmbito do SISVAN é facultativa, priorizando-se exclusivamente marcadores bioquímicos e clínicos para fins de vigilância nutricional.

O SISVAN é operacionalizado apenas por meio de inquéritos populacionais periódicos de abrangência nacional, não sendo integrado à rotina da Atenção Primária à Saúde.