É permitida à farmácia de manipulação a dispensação de medicamentos manipulados em substituição a medicamentos industrializados, sejam de referência, genéricos ou similares.

É vedada às farmácias a manipulação de Clonidina, pois é uma substância de baixo índice terapêutico, com alta dosagem e baixa potência.

Nas Boas Práticas de Manipulação de Produtos Estéreis em Farmácias, recomenda-se que a sala destinada à lavagem, esterilização e despirogenização dos recipientes vazios deva ser separada e possuir classificação ISO 7 (10.000 partículas/pé cúbico ar).

A preparação de doses unitárias ou a unitarização de doses por transformação/adequação ou subdivisão da forma farmacêutica, mesmo havendo recomendação específica do fabricante, o período de uso deve ser o mesmo das preparações extemporâneas, ou seja, até 48 horas de validade.

O preparo de doses unitárias e a unitarização de doses de medicamentos são permitidos exclusivamente às farmácias de atendimento privativo de unidade hospitalar ou qualquer equivalente de assistência médica.