Na colite ulcerativa há comprometimento inflamatório resultando em fissuras, fístulas e abscessos na cavidade abdominal.

Além dos linfócitos T CD4+, anticorpos anti-citoplasma de neutrófilos (p-ANCA) e antitropomiosina desempenham papel relevante na patogênese dessass doenças.

A doença de Crohn é caracterizada por inflamação transmural que se estende por todas as camadas da parede intestinal.

Não há risco maior de surgimento de câncer de cólon em pacientes com doenças inflamatórias intestinais.