O Conselho de Administração da EBSERH terá três membros indicados pelo Ministério da Saúde.

Os membros do Conselho de Administração da EBSERH terão gestão de 2 anos, sem recondução ao cargo.

O representante dos empregados da EBSERH participará das discussões e deliberações sobre assuntos que envolvam relações sindicais, remuneração, benefícios e vantagens, inclusive assistenciais ou de previdência complementar, hipóteses em que fica configurado o conflito de interesses, sendo estes assuntos deliberados em reunião separada e exclusiva para tais fins.

O Conselho de Administração da EBSERH deverá ser composto por sete membros, nomeados pelo Ministério de Estado da Saúde.

Compete ao Conselho de Administração da EBSERH fixar as orientações gerais das atividades da EBSERH.