O local de máxima absorção da toxina botulínica é o intestino grosso, de onde segue para o sistema linfático e posteriormente alcança a corrente sanguínea.

O botulismo é causado por uma toxina produzida pelo Clostridium botulinum, um bacilo Gram negativo, aeróbio, esporulado.

O dano causado na membrana pós-sináptica pela toxina é temporário. A recuperação depende da formação de novas terminações neuromusculares e, por este motivo, a recuperação clínica é prolongada, podendo variar de um a 12 meses.

A toxina absorvida no trato gastrintestinal ou no ferimento dissemina-se por via hematogênica até as terminações nervosas, mais especificamente a membrana pré-sináptica da junção neuromuscular, bloqueando a liberação da acetilcolina.