Apenas os órgãos da administração direta e indireta estão submetidos à respectiva esfera de competência do Tribunal de Contas do Estado de Santa Catarina. 

Dentre os deveres do Tribunal de Contas do Estado de Santa Catarina está o encaminhamento semestral e anual do relatório de suas atividades à Assembleia Legislativa.

É juridicamente permitida a atuação do Tribunal de Contas do Estado de Santa Catarina como órgão consultivo, desde que observada a matéria sujeita a sua fiscalização.

As competências do Tribunal de Contas do Estado de Santa Catarina contam com previsão normativa constitucional apenas no âmbito da Constituição do Estado de Santa Catarina de 1989, dispondo a Constituição da República Federativa do Brasil de 1988 tão somente sobre aquelas conferidas exclusivamente ao Tribunal de Contas da União.

No que se refere ao cargo de Conselheiro do Tribunal de Contas do Estado de Santa Catarina é juridicamente possível a nomeação do brasileiro que conte com sessenta e cinco anos de idade; idoneidade moral e reputação ilibada; notórios conhecimentos jurídicos, contábeis, econômicos e financeiros ou de administração pública; e, pelo menos, dez anos de exercício profissional em atividade profissional que exija os citados conhecimentos.