A respeito de predição de estrutura de proteínas, de redes de computadores e Internet, de técnicas de análise de expressão gênica em escala, de técnicas de sequenciamento de DNA em escala e de visualização e manipulação de estruturas de macromoléculas biológicas, julgue o item seguinte. 

No sequenciamento de DNA com grande quantidade de sequências repetitivas, genomas comparativos, polimorfismos e genes diferencialmente expressos são atualmente muito estudados por meio de microchips de DNA, também conhecidos como microarranjos, sequenciamento por síntese. 

A respeito de predição de estrutura de proteínas, de redes de computadores e Internet, de técnicas de análise de expressão gênica em escala, de técnicas de sequenciamento de DNA em escala e de visualização e manipulação de estruturas de macromoléculas biológicas, julgue o item seguinte. 

Com os avanços no campo da biotecnologia, simulações de processos em escala de bancada são necessárias para a geração de parâmetros a serem adotados em operação de plantas de produção em grande escala. 

A respeito de predição de estrutura de proteínas, de redes de computadores e Internet, de técnicas de análise de expressão gênica em escala, de técnicas de sequenciamento de DNA em escala e de visualização e manipulação de estruturas de macromoléculas biológicas, julgue o item seguinte. 

A identificação de genes de certa planta relacionados à resistência ou mesmo à suscetibilidade da planta a determinado patógeno pode ser realizada por meio do sequenciamento de alta profundidade do transcritoma da planta. 

A respeito de predição de estrutura de proteínas, de redes de computadores e Internet, de técnicas de análise de expressão gênica em escala, de técnicas de sequenciamento de DNA em escala e de visualização e manipulação de estruturas de macromoléculas biológicas, julgue o item seguinte. 

Ferramentas de IA, como o AlphaFold, permitem predições de estrutura de proteínas. 

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue o seguinte item. 

A bioinformática trata do manuseio de dados genômicos, seja para tratamento da estrutura e do armazenamento dos dados, seja para a análise e geração de conhecimento em processos automáticos ou semiautomatizados.  

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue o seguinte item. 

Na área de genética e biologia molecular, com ênfase em bioinformática, a análise de dados em sistemas de informação biológicos e os bancos de dados biológicos são ferramentas de análise e comparação de genomas, probabilidade e estatística aplicada ao melhoramento animal e à experimentação agropecuária, não tendo, porém, eficácia na geração de marcadores moleculares. 

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

As matrizes de substituição são fundamentais para a realização de alinhamentos de sequências biológicas, e as variantes BLOSUM e PAM são o padrão em programas como o CLUSTAL W e BLAST, visto que elas modulam a taxa de substituição entre os aminoácidos e nucleotídeos que fornecem escores para as lacunas (gaps). 

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

O alinhamento de duas sequências biológicas é um exemplo clássico de  utilização da programação dinâmica, especificamente para contemplar os diferentes tipos de alfabetos de caracteres no DNA e nas proteínas. 

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

Na anotação genômica, é fundamental o estabelecimento de relações evolutivas e funcionais com espécies afins, e a busca por ortólogos é central para os esforços de transferência de anotação funcional, o que pode ser feito por meio de buscas em bancos de dados curados com grupos de genes ortólogos, como o KEGG. 

Em relação às técnicas “ômicas”, julgue o item seguinte. 

Estudos de genômica comparativa em plantas revelam que, dentro de uma espécie, enquanto os genes codificadores de proteínas são estritamente conservados, observa-se uma divergência evidente em termos de variantes estruturais nos genomas, fundamental para a determinação de características fenotípicas de interesse para a produção agrícola. 

Em relação às técnicas “ômicas”, julgue o item seguinte. 

Nas análises metabolômicas por ressonância nuclear magnética, as intensidades dos picos de detecção dos metabólitos são geralmente indicativas da concentração absoluta desses metabólito, enquanto as técnicas baseadas em espectrometria de massa não são correlacionadas com as concentrações absolutas, mas pode-se estabelecer uma quantificação relativa dos metabólitos a partir da comparação com uma amostra de referência. 

Em relação às técnicas “ômicas”, julgue o item seguinte. 

Entre as técnicas de redução de complexidade de genomas para diminuir custos de descoberta e genotipagem simultânea de milhares de marcadores genéticos estão a utilização de enzimas de restrição e seleção de fragmentos por tamanho (GBS e RADseq) e o RNA-seq. 

Considerando as informações precedentes, julgue o item subsequente. 

No contexto analisado, a fosforilação da enzima X inibe sua atividade. 

Considerando essa situação hipotética, julgue o item a seguir. 

Se for usada cromatografia de exclusão molecular, deve-se separar o extrato da resina por centrifugação branda, mantendo-se a fração ativa no sobrenadante. 

Julgue o item subsecutivo, em relação às técnicas ômicas aplicadas na avaliação da regulação de expressão gênica e ao fluxo da informação genética. 

Fatores sigma, sistema dois componentes, proteína ativadora de quorum sensing e riboswitches são elementos que atuam na regulação da expressão gênica transcricional em bactérias. 

Julgue o item subsecutivo, em relação às técnicas ômicas aplicadas na avaliação da regulação de expressão gênica e ao fluxo da informação genética. 

Além das avaliações globais da expressão gênica, é possível, também, avaliar os níveis de metabólitos totais e específicos, bem como rastreá-los em seus diferentes caminhos por meio da utilização de substratos marcados com carbono-13 (¹³C) e nitrogênio-15 (¹⁵N). 

Julgue o item subsecutivo, em relação às técnicas ômicas aplicadas na avaliação da regulação de expressão gênica e ao fluxo da informação genética. 

Interatoma é um termo que designa especificamente as interações entre proteínas catalíticas e estruturais, estendendo-se às análises dessas associações pelas metodologias de metabolômica, proteômica e cristalografia. 

Julgue o item subsequente, relacionados às metodologias de sequenciamento e análises de ácidos nucleicos. 

A identificação de RNA não codificador, excetuando-se rRNA e tRNA, dificulta a análise e anotação de genomas, devido à baixa homologia na sequência linear, a exemplo dos RNAs reguladores, que preservam a estrutura tridimensional sem homologia na sequência primária. 

Julgue o item subsequente, relacionados às metodologias de sequenciamento e análises de ácidos nucleicos. 

Com a evolução dos métodos de sequenciamento de ácidos nucleicos, as leituras de fragmentos curtos, de 700 pb a 900pb, caraterísticas da metodologia de Sanger, tornaram-se obsoletas, tendo sido substituídas pelas leituras de fragmentos longos, de 10 kb a 50 kb, próprias da metodologia de nanoporos.