O uso da creatinina como medida da TFG, apresenta várias desvantagens. Uma delas é que, embora a taxa de produção seja razoavelmente constante, é observada uma variação individual considerável, dependendo principalmente da massa muscular.

A uréia sérica é bastante utilizada como medida de disfunção renal, porém não possui grande valor como medida da TFG.

A TFG pode ser quantificada utilizando-se o iotalamato não marcado para amostras de urina e sangue, com a óbvia vantagem de dispensar o uso de materiais radioativos.

As substâncias endógenas amplamente empregadas para determinar a TGF incluem a creatinina, a piridinolina e a cistatina C.