Ao prescrever o tratamento, deve-se atentar para o fato de que a dose de ataque de 20 mg/kg de citrato de cafeína equivale a 20 mg/kg de cafeína-base, não sendo necessária a correção farmacológica entre as apresentações. 

A cafeína é preferida em relação à teofilina exclusivamente por sua via de administração ser apenas intravenosa, garantindo uma absorção mais errática e controlada em prematuros com sistema gastrointestinal imaturo.

A monitorização dos níveis séricos de cafeína deve ser realizada semanalmente em todos os RNPT em tratamento, visto que o citrato de cafeína possui janela terapêutica estreita e alto risco de toxicidade cardiovascular severa em doses de manutenção de 5 mg/kg/dia.

A dose de manutenção recomendada para o citrato de cafeína é de 20 mg/kg a cada doze horas, visando a manter a estimulação constante do diafragma e prevenir a fadiga muscular respiratória. 

O mecanismo de ação das metilxantinas baseia-se primordialmente no antagonismo dos receptores de adenosina, o que resulta no aumento da sensibilidade central ao dióxido de carbono e na redução do limiar de resposta respiratória.