Questões da Prova FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA

Um pesquisador está tentando sequenciar um gene conservado de um pombo. Entretanto, no momento de escolher os primers para PCR, ele observou que não dispõe de primers, para as regiões flanqueadoras do gene, específicos para Aves. Os primers disponíveis no laboratório estão os que foram desenhados para as espécies indicadas nas alternativas.

Assinale a melhor escolha de forma a otimizar a probabilidade de amplificação do fragmento em questão. 

A maior parte dos algoritmos de alinhamento múltiplo de sequências faz uso de uma matriz de pontos (dot-matrix). Na primeira fase do alinhamento par a par, cada par de sequências é disposto nesta matriz com uma sequência na primeira linha e a outra na primeira coluna.

Todos os pares possíveis de sequências são analisados na matriz de pontos, onde um ponto indica ____________ das duas sequências a serem alinhadas par a par.

Assinale a alternativa que complete corretamente a frase acima. 

Um técnico acabou de sequenciar um fragmento de uma região codificadora de uma enzima para quatro espécies de roedores. Examinando o alinhamento múltiplo final, a explicação mais provável para o padrão encontrado é: 

Seq. 1: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 2: ATG GAA GAA ATT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 3: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

Seq. 4: ATG GAA GAA –TT ACA AGG ATA TTT AGA AAA ACC

A explicação mais provável é que: 

Um pesquisador estava fazendo um estudo comparativo entre genomas de duas espécies de plantas. Em particular, ele analisou sequências de dois genes não homólogos codificadores de proteínas. Dentre as metodologias de análise, ele calculou a proporção de nucleotídeos diferentes pelo total de nucleotídeos comparados (p).

Sobre o tema, analise as afirmativas a seguir.

I. Quando comparado com íntrons do mesmo gene, os éxons vão mostrar um p maior entre as espécies de plantas.

II. As proteínas não homólogas irão mostrar uma proporção de 25% de aminoácidos idênticos.

III. O numerador de p é exatamente o somatório do número de transições com o de transversões entre as sequências.

Assinale: 

Veja o gráfico abaixo que destaca o aumento na distância observável entre duas sequências com o aumento do número de mutações acumuladas desde o ancestral comum entre elas (distância real).

                                 

A partir do gráfico, analise as afirmativas a seguir.

I. Sequências mais próximas filogeneticamente apresentam uma proporção menor de variação genética escondida.

II. Caso o número de nucleotídeos diferentes (A,T,C,G) fosse seis ao invés de quatro, a distância observável teria um platô abaixo do observado.

III. A distância observável varia de zero a um, enquanto a real de zero a infinito.

Assinale: