O diagnóstico deve ser suspeitado em qualquer quadro de colestase, com paciente com prurido persistente e fadiga, testes bioquímicos alterados, independente do tempo de evolução.

Títulos séricos elevados de AMA (Anticorpos antimitocôndria) são detectados na totalidade dos casos e a titulação geralmente é elevada (>= 1/80).

Outras doenças autoimunes podem ser vistas com maior frequência em pacientes com CBP (Tireoidite, Doença Celíaca, LES, Síndrome de Sjogren e outras). 

A medicação utilizada para tratamento da CBP é o Ácido Ursodesoxicólico, considerado de 1ª linha, de uso contínuo, na dose de 15 mg/Kg/dia, em qualquer estágio da CBP, inclusive em caso de enzimas colestáticas normais.

A biópsia hepática atualmente é recomendada somente nos casos onde há suspeita de síndrome de sobreposição de doenças como Hepatite autoimune com CBP (Colangite Biliar Primária).