Com relação à apneia da prematuridade, a CPAP nasal tem pequeno efeito sobre a apneia de origem central, porém, é efetiva nas apneias de caráter misto e obstrutivo. Assim sendo, o uso da CPAP diminui a resistência das vias supraglóticas e aumenta o volume intratorácico, reduzindo assim a resistência ao fluxo aéreo. 

Na síndrome da aspiração de mecônio a CPAP utilizada com pressões moderadas age desfazendo atelectasias e impedindo o colapso das vias aéreas terminais, estabilizando-as. 

A CPAP promove melhora da oxigenação e consequentemente reverte a vasoconstrição do leito vascular pulmonar, diminuindo a resistência vascular pulmonar e aumentando o fluxo através desse leito, diminuindo o shunt. 

A aplicação da CPAP aumenta a pressão intratorácica, o que pode levar a uma redução do débito cardíaco por causa da redução do retorno venoso, em contrapartida, o uso de pressão adequada permite máxima oferta de oxigênio aos tecidos, o que diminui o gasto energético. Esses efeitos são pressão-dependentes e devem ser manipulados de acordo com as necessidades de cada doença a ser tratada. 

São candidatos ao uso da CPAP nasal os neonatos prematuros com peso ao nascer inferior a 1.500 g, com quadro de insuficiência respiratória.