O Sistema de Informação do Programa Nacional de Imunização (SI-PNI) permite o cálculo da cobertura vacinal, mas não possibilita acompanhamento de casos de reação adversa ocorridos pós-vacinação. 

O sistema oficial para registro das ações de controle da dengue é o Sistema do Programa Nacional de Controle da Dengue (SisPNCD), que possibilita a inserção dos dados produzidos no território brasileiro em âmbito municipal, estadual e federal. 

O aplicativo (App) para dispositivos móveis, e-SUS Território, é utilizado para monitorização das doenças de notificação compulsória em território nacional.

Os sistemas de informação em saúde em funcionamento no Brasil não permitem o monitoramento de repasses financeiros federais vinculados a programas do Ministério da Saúde. 

O e-SUS Atenção Primária, principal sistema utilizado pelas equipes de atenção primária e da Estratégia Saúde da Família, é composto por softwares e aplicativos para coleta de dados, como o Prontuário Eletrônico do Cidadão (PEC).