Apesar de serem claros os benefícios físicos(coordenação motora, manutenção ou aumento de massa magra e afins), exercícios físicos não atuam sobre fatores emocionais ou socioafetivos em crianças neurodivergentes.

Os baixos níveis de atividade física e aptidão associados ao atraso do desenvolvimento motor em crianças e adolescentes com transtorno do espetro autista podem acompanhar esses déficits e levar a uma maior incidência de sobrepeso e obesidade e complicações de saúde em relação aos jovens com desenvolvimento típico, além de piorar o prognóstico de saúde mental na idade adulta.

O Tai Chi Chuan é uma modalidade de exercício físico sugerido pelo Ministério da Saúde em políticas de promoção de saúde. Todavia, tanto para crianças e adolescentes com transtorno do espetro autista quanto para crianças e adolescentes com transtorno de déficit de atenção e hiperatividade, a modalidade se mostra impraticável, em razão do quanto exige de foco e coordenação dos movimentos do corpo ao mesmo tempo.

O papel da educação física no cuidado de crianças neurodivergentes é fundamental, partindo do entendimento de que a educação física é a educação do corpo, para que este tenha melhores desempenhos e maior qualidade de vida.

O exercício possui também efeitos sobre os aspectos orgânicos envolvidos no transtorno de déficit de atenção e hiperatividade, proporcionando, entre outras, um aumento na produção e da recaptação de serotonina e de adenosina, principais neurotransmissores responsáveis por atenuar os sintomas do transtorno e melhorar as funções executivas do portador do transtorno.