Não há problemas na utilização de ciprofloxacino com antiácidos, cálcio ou leite. Esse medicamento deve ser destinado apenas a pacientes com doenças e síndromes bem definidas, devendo sua utilização ser monitorada. 

Os esquemas das Profilaxias Pós-Exposição (PEP) atuais apresentam alta toxicidade e muitos efeitos adversos. A fim de evitar interrupções, deve-se orientar o paciente sobre os principais eventos adversos e como manejá-los.

Para o esquema de Profilaxia Pré-Exposição (PrEP) diária, recomenda-se o início da profilaxia com uma dose de ataque de 2 comprimidos de tenofovir + entricitabina no primeiro dia de uso, seguidos de 1 comprimido diário nos próximos dias.

O uso concomitante de ciprofloxacino e corticosteroides não aumenta o risco de ruptura no tendão, mas pode causar reações alérgicas graves e fotossensibilidade; assim, recomenda-se utilizar filtro solar.

Há risco de interação entre os antidepressivos inibidores seletivos da recaptação de serotonina e a tiramina, presente em alimentos como queijos envelhecidos, embutidos e vinhos, pode causar uma crise hipertensiva.