A primeira medida para minimizar os riscos de contaminação de mananciais subterrâneos consiste na proteção da borda do poço por meio de revestimento das paredes com PVC, impedindo o arraste das águas pluviais.

A instalação de uma tampa de concreto e o emprego de bombas manuais ou elétricas devem assegurar uma melhor qualidade da água subterrânea. 

As fontes de poluição dos mananciais subterrâneos são encontradas próximas aos poços artesianos, sendo mais facilmente identificáveis.

A preservação dos mananciais subterrâneos depende essencialmente das práticas/atividades adotadas na superfície, uma vez que existem inúmeros sistemas de comunicação entre as águas superficiais e subterrâneas.

É necessária uma drenagem adequada do material lixiviado dos aterros sanitários e a impermeabilização das lagoas de estabilização de esgotos domésticos ou dos efluentes para garantir a preservação da qualidade das águas subterrâneas.