O sistema nervoso, sob o enfoque embriológico, é derivado do ectoderma, formando o tubo neural e, posteriormente, as vesículas primordiais, a partir das quais ocorrem diferenciações, com a formação do encéfalo e da medula espinhal. 

Os tálamos, a glândula pineal e o aqueduto mesencefálico estão dispostos ao longo do terceiro ventrículo. 

O sistema nervoso autônomo apresenta os componentes simpático e parassimpático, que inervam, por meio aferente, os tecidos glandulares e os músculos cardíacos lisos e estriados. 

A origem aparente dos nervos oculomotor, troclear e trigêmeo é identificada no mesencéfalo.