Os resultados dos ensaios realizados pelo controle de qualidade devem ser registrados na ordem de manipulação, junto com as demais informações da preparação manipulada. O farmacêutico deve avaliar os resultados, aprovando ou não a preparação para dispensação.

A farmácia não pode manipular e manter estoque mínimo de preparações oficinais nem de bases galênicas, mesmo garantindo a qualidade e estabilidade das preparações. 

As farmácias não podem manipular substâncias de baixo índice terapêutico, mesmo com autorização da Vigilância Sanitária local.

As farmácias devem possuir uma única sala específica para a manipulação desses três tipos de medicamentos, hormônios, antibióticos e citostáticos, com sistema de ar independente das outras salas de manipulação da farmácia.

É permitido manipular preparações sólidas, semissólidas e líquidas em uma mesma sala de manipulação. Exigindo, apenas, que haja um exaustor específico para cada um desses tipos de preparação.