Uma das causas da diarreia pode ser a contaminação bacteriana e/ou hiperosmolaridade das soluções enterais, além da velocidade de infusão da dieta.

A diarreia pode ser em razão do uso de antiácidos à base de hidróxido de magnésio e ao uso de antibióticos de largo espectro, que não alteram a flora intestinal, mas produzem uma redução de bactérias e de gases.

Níveis baixos de hemoglobina levam à má-absorção e diarreia, pois a hemoglobina sérica é um fator importante na manutenção da pressão osmótica, que ajuda a aumentar a capacidade de absorção das vilosidades intestinais.

Náuseas, cólicas e distensão abdominal podem ser atribuídas à infusão lenta da solução ou a situações em que o esvaziamento gástrico é retardado.

Sondas de grosso calibre aumentam a capacidade de contração do esfíncter esofágico inferior, aumentando o risco de refluxo gástrico e de pneumonia aspirativa, que pode ser evitada mantendo o paciente na posição sentada ou semissentada durante a administração da dieta.