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Se em uma reação de sequenciamento pelo método de Sanger, o...

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Q252138 Biologia
Se em uma reação de sequenciamento pelo método de Sanger, o análogo didesoxi do CTP (ddCTP) fosse acrescentado à mistura de reação em uma concentração maior que aquela do dCTP, isso poderia afetar os resultados da seguinte forma:

Alternativas

Gabarito comentado

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Gabarito: E

A alternativa correta é a E, e vamos entender detalhadamente o porquê.

O método de sequenciamento de Sanger se baseia na incorporação de nucleotídeos modificados, chamados de didesoxinucleotídeos (ddNTPs), que interrompem a síntese da cadeia de DNA quando incorporados. Esses nucleotídeos não possuem o grupo 3'-hidroxila necessário para a formação da ligação fosfodiéster entre nucleotídeos adjacentes, o que faz com que a síntese da cadeia de DNA seja interrompida.

Para resolver essa questão, é necessário compreender como a concentração de ddNTPs em relação aos dNTPs (nucleotídeos normais) afeta o resultado do sequenciamento.

Vamos analisar cada alternativa com base nesse entendimento:

A - Esta alternativa está incorreta. Na verdade, os trechos sequenciados seriam mais curtos, e não mais longos, porque a alta concentração de ddCTP aumentaria a probabilidade de interrupção precoce da síntese da cadeia de DNA.

B - Também incorreta. A DNA polimerase dará início à reação de duplicação, mas a frequência de interrupções será maior devido à alta concentração de ddCTP. Portanto, produtos seriam formados, mas seriam curtos.

C - Esta alternativa sugere um entendimento equivocado do processo. A alta concentração de ddCTP não significa que haverá excesso de nucleotídeos de citosina nos resultados, mas sim que a síntese da cadeia de DNA será interrompida mais frequentemente onde o ddCTP é incorporado.

D - Incorreta. A formação de oligonucleotídeos de cadeia dupla com pareamento entre citosina e guanina não é o fator determinante aqui. O que realmente importa é a interrupção da síntese da cadeia de DNA pela incorporação de ddCTP.

E - Correta. Com a alta concentração de ddCTP, a probabilidade de incorporação desse análogo aumenta significativamente, resultando em interrupções prematuras frequentes. Isso faz com que a sequência completa do DNA não possa ser determinada, pois as cadeias serão interrompidas muito cedo e frequentemente.

Portanto, a adição de uma concentração maior de ddCTP do que dCTP na reação de sequenciamento pelo método de Sanger aumenta a probabilidade de interrupções prematuras, fazendo com que seja impossível sequenciar inteiramente o DNA. Isso justifica a alternativa E como a correta.

Espero que essa explicação tenha esclarecido suas dúvidas. Estou à disposição para quaisquer outras questões sobre o tema!

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Comentários

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No método de sequenciamento de Sanger os ddNTP (didesoxirribonucleotídeos) são adicionados com intuito de parar o sequenciamento.

O Fundamento do método de Sanger é copiar bases de interesses do DNA; fazer varias cópias; e produzir fragmentos de tamanhos diferentes. Adicionando uma quantidade maior de ddCTP iria ocorrer, precocemente, a parada de leitura das bases de interesses, ocorrendo erro na sequência da DNA.

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