Para obter cerca de 20 mg por aplicação com enxaguatório a 0,12%, basta bochechar 10 ml por 30 segundos, pois doses maiores não oferecem vantagem clínica. 

Aumentar a concentração acima do necessário eleva proporcionalmente o efeito clínico sem impacto nos eventos adversos, já que a clorexidina não apresenta relação dose-resposta.

A clorexidina apresenta alta substantividade, capacidade de penetrar e atuar no biofilme e efeito antiplaca adicional por interferir na adesão bacteriana; enxaguatórios a 0,12–0,2% reduzem placa de forma superior aos de óleos essenciais, e o evento adverso mais comum é a coloração dentária e lingual, potencializada por cromógenos; sistemas antidescoloração podem atenuar manchas, mas podem também reduzir a eficácia.

Dentifrícios com clorexidina são sempre ineficazes devido à inativação do agente na formulação, não havendo estudos que mostrem benefício em placa ou gengivite.

Não há preocupação com aquecimento das formulações; a formação de 4-cloroanilina não é relatada e o uso prolongado induz supercrescimento de oportunistas, motivo pelo qual é contraindicado por mais de 2 semanas.