O vírus da febre amarela é um arbovírus do gênero Flavivirus, protótipo da família Flaviviridae. 

No ciclo silvestre da febre amarela, os humanos são considerados os principais hospedeiros, amplificadores do vírus, e são vítimas da doença assim como os primatas não humanos que, nesse ciclo, apresenta-se como hospedeiro acidental. 

No ciclo urbano da febre amarela, o ser humano é o principal hospedeiro com importância epidemiológica, e as espécies de culicídeos (mosquitos vetores) implicadas na transmissão são do gênero Aedes, principalmente o Ae. aegypti, mantendo-se um ciclo homem-mosquito. 

Na febre amarela não há transmissão de pessoa a pessoa.