O tratamento nutricional para a síndrome do cólon irritável tem como objetivo assegurar a ingestão adequada de nutrientes e minimizar os sintomas, incluir uma dieta pobre em fibra (10g/dia), diminuir a ingestão hídrica e o fracionamento das refeições. 

A intolerância secundária à lactose pode se desenvolver como consequência de infecções no intestino delgado, doenças inflamatórias, desnutrição e síndrome da imunodeficiência adquirida.

A doença de Chron e a retocolite ulcerativa apresentam características clínicas em comuns, tais como diarreias com pus, presenças de cálculos biliares e fístulas recorrentes, determinando tratamento nutricional semelhante. 

O tratamento nutricional da doença celíaca consiste em incluir na dieta os cereais, tais como trigo, cevada, aveia e malte. 

O tratamento nutricional para redução de esofagite e refluxo inclui a utilização de suplementos alimentares à base de ácidos graxos ômega 3, que aumentam a pressão no esfíncter inferior, reduzindo a produção latente de ácido gástrico.