O e-mail tem mais flexibilidade se comparado com o padrão ofício e outras formas de comunicação, porém ainda assim entram certas regras, como o uso de linguagem formal. O uso de emoji é algo proibido até na comunicação de empresas privadas, imagina em comunicação oficial do serviço público.

A mensagem do correio eletrônico deve ser revisada com o mesmo cuidado com que se revisam outros documentos oficiais. O texto profissional dispensa manifestações emocionais. Por isso, ícones e emoticons não devem ser utilizados. Com essa passagem, identificamos que a linguagem de um e-mail, além de ser formal, não pode conter emojis. 

Fonte: Projeto Caveira.