No caso de patologias retrococleares, é possível encontrar emissões presentes mesmo com perda auditiva acima de 45 dBHL e potencial auditivo de tronco encefálico comprometido, já que as emissões otoacústicas refletem a atividade pré-neural na cóclea.

Crianças pequenas podem apresentar potencial evocado auditivo de tronco encefálico ausente e emissões otoacústicas presentes, o que confirma o diagnóstico de espectro da neuropatia auditiva.

As emissões otoacústicas podem ser usadas para acompanhamento de pacientes em uso de drogas ototóxicas, pois afetam primeiramente as células ciliadas internas. 

Estudos recentes indicam que existe alta correlação entre os limiares audiométricos e as curvas das emissões otoacústicas, podendo estas eventualmente substituir o exame audiométrico para estimar os limiares auditivos. 

Os potenciais evocados auditivos de tronco encefálico e as emissões otoacústicas passam por processo de maturação após o nascimento.