Há a recomendação (classe IIa) de profilaxia para endocardite bacteriana em procedimentos odontológicos com manipulação da gengiva, da região periapical dentária e perfuração da mucosa oral, para todos os pacientes com lesões valvares regurgitantes.

Pacientes com cardiopatia congênita, submetidos à sua correção total, não necessitam de profilaxia para endocardite bacteriana, exceto aqueles com cardiopatia congênita cianogênica e submetidos à cirurgia paliativa.

Pacientes com prótese valvar submetidos à cirurgia, há menos de um ano e que desenvolvem endocardite com cultura negativa, devem receber vancomicina, rifampicina e cefepime, durante seis semanas, além de gentamicina durante duas semanas.

O quadro de endocardite bacteriana precoce após o implante de prótese valvar ocorre até os dois primeiros meses após a cirurgia, sendo o principal agente o estreptococo.