A digestão de alimentos é acompanhada pela hidrólise enzimática. Cofatores, como o ácido clorídrico, bile e bicarbonato de sódio, facilitam os processos de digestão e absorção.

As enzimas digestivas são sintetizadas em células especializadas da boca, estômago, pâncreas e intestino delgado e secretadas no lúmen.

Algumas enzimas estão localizadas nas membranas lipoproteicas das células das mucosas e se ligam aos seus substratos conforme eles entram na célula.

O intestino grosso secreta pequena quantidade de enzimas digestivas como por exemplo a nucleotidase e a enteroquinase.