Dentre os medicamentos utilizados na terapia farmacológica para modificar o curso da doença, estão as beta-interferonas e o acetato de glatiramer. 

De acordo com os critérios de McDonald, considera-se surto da doença todo evento que seja típico de um episódio desmielinizante agudo com duração de, pelo menos, 12 horas e com a presença de pico febril. 

É classificada como esclerose múltipla primária progressiva a primeira manifestação clínica que apresenta características de desmielinização inflamatória sugestiva de esclerose múltipla, mas incapaz de cumprir os critérios de disseminação no tempo por exames. 

Para pacientes abaixo dos 18 anos, recomenda-se a terapia com fumarato de dimetila. 

Durante a gestação, as manifestações clínicas da doença ficam mais acentuadas, com importante aumento da taxa de surtos e progressiva redução da incidência logo após o puerpério.