Um grupo de pesquisa está estudando os níveis de expressão ...
Gabarito comentado
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Tema central: Quantificação de expressão gênica por qPCR (RT-qPCR) em camundongos, com uso de cDNA, gene de referência para normalização e curva padrão para avaliar eficiência e quantificar.
Alternativa correta: C – A curva padrão na qPCR é construída a partir de diluições seriadas de um padrão conhecido. A partir da relação Cq (Ct) vs. log da concentração, obtém-se: (1) eficiência da reação (ideal entre 90–110%, slope ~ -3,1 a -3,6) e (2) a quantificação do alvo nas amostras por interpolação. Isso é essencial para validação do ensaio e para quantificação absoluta (e também para checar se a quantificação relativa é confiável). Referência: MIQE Guidelines (Bustin et al., Clin Chem, 2009).
Por que as demais estão incorretas?
A) “qPCR mede diretamente o RNA, sem cDNA.” Incorreto. A quantificação de RNA exige transcrição reversa para gerar cDNA (RT-qPCR). qPCR sem RT mede DNA, não RNA. MIQE recomenda controles no-RT para excluir DNA genômico.
B) “Gene de referência só verifica extração e não interfere.” Errado. Genes de referência (housekeeping) servem para normalizar variações de quantidade/qualidade de cDNA e eficiência de pipetagem entre amostras, permitindo quantificação relativa (método ΔΔCq). Devem ser estáveis no contexto experimental e idealmente validados (ex.: geNorm/NormFinder). MIQE recomenda usar mais de um gene estável.
D) “Fluorescência é proporcional ao consumo do primer.” Falso. A fluorescência reflete o acúmulo do produto de PCR: por corantes intercalantes (SYBR Green) que se ligam ao DNA dupla-hélice, ou por sondas (TaqMan) clivadas durante a extensão, liberando fluorescência. Não há monitoramento do consumo de primer.
E) “Não requer gene de referência ao comparar amostras.” Inadequado. Em quantificação relativa, a normalização por gene(s) de referência é padrão-ouro para correção de variações técnicas. Só em quantificação absoluta rigorosamente controlada (padrões externos, normalização por massa e/ou spike-ins) poderia-se dispensar housekeeping, o que não é o usual. MIQE desaconselha omitir normalização.
Dicas de prova e prática:
- Palavras-chave que sinalizam a resposta: curva padrão, eficiência, normalização, cDNA.
- Cheque eficiência (90–110%), R² > 0,99, e curva de dissociação (SYBR) para especificidade.
- Use controles: no-template (contaminação), no-RT (DNA genômico).
Referências essenciais: Bustin SA et al. The MIQE Guidelines (Clin Chem, 2009); Applied Biosystems – Real-Time PCR Systems Chemistry Guide.
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