A associação de antipsicóticos não é recomendada como estratégia de primeira linha no TEA, porém, pode ser considerada em casos excepcionais de sintomas comportamentais graves e refratários, particularmente, na presença de deficiência intelectual associada. 

O Citalopram é preferível ao Escitalopram em pacientes com TEA e cardiopatia devido ao menor potencial de prolongamento do intervalo QT.

A Fluoxetina deve ser administrada pela manhã, devido ao risco de insônia ou agitação noturna, se administrada à noite.

O uso de antidepressivos como o Escitalopram deve ser monitorado, especialmente, quanto ao risco de síndrome serotoninérgica cuja manifestação é caracterizada por mioclonia, hiperreflexia, agitação, confusão, diarreia, febre e hipomania.