a higienização compreende a etapa de desinfecção, podendo ser substituída por uma triagem visual eficiente, desde que as frutas aparentem boa qualidade externa. 

o uso de detergentes neutros é a etapa mais importante da higienização, sendo suficiente para eliminar todos os microrganismos patogênicos encontrados nas frutas.

após a lavagem, a imersão das frutas em solução clorada ou outro sanitizante permitido é uma prática recomendada para garantir maior segurança do alimento.

a aplicação direta de sanitizante sem pré-lavagem é recomendada para preservar a integridade da casca, evitar rachaduras e manter a qualidade das frutas. 

a higienização deve ser realizada nas frutas destinadas à industrialização em sucos, pois frutas inteiras têm baixa contaminação superficial e não precisam da ação de saneantes.