A composição da microbiota associada às infecções peri-implante pode ser similar a aquela da periodontite crônica, com uma infecção anaeróbica mista dominada por bactérias gram-negativas, mas em alguns casos podem incluir bastonetes entéricos, fungos ou microrganismos associados a infecções extra orais, como estafilococos.

Na peri-implantite, a profundidade de sondagem é maior ou igual a 5 mm e frequentemente existe supuração.

A abordagem mecânica não cirúrgica isolada parece ser efetiva tanto no tratamento da mucosite peri-implante, quanto da peri-implantite. 

Existe nova evidência de que pacientes que têm histórico de periodontite tratada tenham um elevado risco de infecções peri-implante.