O processo conhecido como imunoprecipitação é uma defesa importante contra vírus. A ligação de anticorpos a esses patógenos cria um bloqueio, impedindo-os de entrarem nas células alvo e se replicarem.

O revestimento dos patógenos e de partículas estranhas por anticorpos, permitindo o reconhecimento da haste do anticorpo por receptores dos fagócitos, com posterior fagocitose do corpo estranho, é denominado pinocitose. 

A estrutura da cadeia pesada de um anticorpo define sua classe e sua função. Existem quatro principais classes de cadeias pesadas ou isotipos: imunoglobulina M (IgM), imunoglobulina G (IgG), imunoglobulina A (IgA) e imunoglobulina E (IgE).

As regiões constantes na molécula dos anticorpos ligados a bactérias formam receptores para a primeira proteína componente do sistema do complemento. Assim, a produção de anticorpos potencializa a ativação complementar.

Antígenos, como proteínas, podem apresentar tamanhos similares, ou até maiores que o anticorpo que os reconhecem. Assim, esses grandes peptídeos não podem ser combatidos pela via dependente de anticorpos.