O seio maxilar possui uma forma piramidal. A base da pirâmide está voltada para o osso zigomático e seu ápice coincide com a parede lateral da cavidade nasal. O teto do seio é também o assoalho da órbita.

O seio é revestido com epitélio respiratório (epitélio colunar pseudo-estratificado ciliado) que recobre um tecido conjuntivo isolado altamente vascularizado. Logo abaixo do tecido conjuntivo, imediatamente próximo às paredes ósseas do seio, está o periósteo.

O seio possui uma porta de drenagem alta, não-fisiológica, em sua parede medial (óstio maxilar), que se abre na cavidade nasal entre as conchas nasais superior e média. 

Um ou mais septos, chamados de “septos de Schneiderian”, podem dividir o seio maxilar em diversos segmentos.