Sabe-se que a citrulinação é um dos principais processos para a formação de autoantígenos através da conversão de resíduos de lisina. Mas também é descrita a carbamilação, que consiste na conversão de resíduos de arginina.

Na articulação inflamada, a presença de determinadas citocinas pode levar à ativação de células B na ausência de antígenos. Uma delas é a IL-10 produzida por macrófagos sinoviais.

A metalopeptidase (MMP) 13 produzida por macrófagos parece ter uma papel importante na destruição articular devido a sua avidez pelo colágeno do tipo II.

Múltiplas citocinas parecem estar envolvidas no desenvolvimento da sinovite, como TNF, IL-1, IL2, IL-6, IL-18 e TGF-beta. A IL-17 parece ter pouca participação, visto que o seu bloqueio apresenta pouco efeito nos pacientes com a doença.

As células dendríticas têm papel importante na apresentação de antígenos e consequente formação de autoanticorpos pelas células B. Entretanto possui pouca influência na diferenciação das células T.