A matriz é o material extracelular produzido pelo hospedeiro, no qual as células do biofilme estão embutidas. 

Na maioria dos biofilmes, os microrganismos representam mais de 50% da massa seca. 

O estado de biofilme dos microrganismos pode levar a um aumento na virulência e na propensão a causar infecção. 

Os microrganismos sempre vivem como culturas puras de células que se acumulam em agregados monomicrobianos. 

Consiste em uma conglomeração monofásica de biopolímeros, conhecidos como substâncias poliméricas extracelulares (EPS), que formam o esqueleto para a arquitetura tridimensional do biofilme e são responsáveis pela adesão às superfícies e pela coesão no biofilme.