No caso de uma FRV, o paciente pode queixar-se de dor ou sensibilidade no dente em questão ou vizinho.

No caso da bolsa associada à FRV, se a fístula estiver localizada na furca do molar, essa observação não necessariamente indica uma FRV, na medida em que o abscesso periapical de um insucesso do tratamento endodôntico também pode drenar em uma localização coronária.

As bolsas periodontais são coronariamente amplas, enquanto as bolsas associadas à FRV são aderidas e profundas.

Uma FRV de longo tempo é mais difícil de ser detectada, uma vez que a destruição maior do osso alveolar adjacente à raiz já ocorreu. 

A American Association of Endodontists determinou, em 2008, que um defeito periodontal estreito encontrado na sondagem com fístula associado a um dente que foi submetido a tratamento endodôntico, independentemente da colocação de um pino, pode ser considerado patognomônico da presença de FRV.