A mutação do gene APC, localizada no cromossomo 5q21, segue padrão de herança autossômico recessivo. 

A mutação do gene MSH2 é a mais comum na PAF clássica, associada à presença de pólipos hamartomatosos. 

A mutação germinativa do gene APC segue padrão dominante. 

A presença de múltiplos pólipos hamartomatosos é suficiente para diagnóstico de PAF, independentemente de teste genético. 

É causada por mutações somáticas do gene TP53 e está associada ao câncer de cólon em idosos.