A análise confirmatória de infecção por HIV (sigla do inglês Human Immunodeficiency Virus) é realizada por punções e fibrobroncoscopia para detecção de ácido nucleico do vírus.

Caso o laboratório que realizou os testes de triagem não realize os testes de confirmação de resultados iniciais, este fica encarregado de conduzir o doador para algum estabelecimento competente no prazo de trinta dias.

Se os testes de triagem forem reagentes, e os testes de confirmação não reagentes, não há a necessidade de repetição. Recomenda-se dispensar imediatamente o doador e informá-lo da sua plena disponibilidade para novas doações.

Para a confirmação do antígeno de superfície do vírus da hepatite B (HBsAg), deve-se realizar teste de neutralização, ou segundo teste com reagente de outra origem, ou de outro fabricante, ou teste de detecção de ácido nucleico do vírus da hepatite B.

Caso o resultado em duplicata se mantenha reagente positivo para ascaridíase, o teste de confirmação ocorre a partir da detecção do protozoário em amostra fecal, podendo ser utilizados métodos de baixa sensibilidade (com o uso de polietilenoglicol) como imunofluorescência e hemaglutinação.