A eficiência de uma dada coluna aumenta com a diminuição do tamanho das partículas da fase estacionária.

A técnica de cromatografia liquida de ultraeficiência (CLUE) possui a vantagem de trabalhar com pressões menores provocando uma melhora na resolução e no tempo de análise.

O aquecimento de uma coluna cromatográfica geralmente diminui a viscosidade do solvente, reduzindo o tempo de retenção e melhorando a resolução da análise.

Quanto à fase estacionária, os suportes mais comuns são constituídos por partículas microporosas de silica. A maior parte dos tipos de silica não deve ser usada acima de pH 8, pois elas se dissolvem em soluções básicas.

Em uma separação de fase reversa, a força eluente diminui quando o solvente se torna mais polar.