Substituiu o fracassado sistema de capitanias hereditárias e promoveu a centralização da administração colonial, fato que favoreceu, dentre outras coisas, a ocupação, a aplicação da justiça e a intensificação das atividades econômicas, sobretudo a produção açucareira.

Viabilizou o início das ações dos jesuítas no Brasil, por meio das quais foi possível a celebração da Paz de Iperiog, em 1563, com os indígenas da Confederação dos Tamoios, então articulada com os franceses contra os portugueses.

Incentivou e disponibilizou recursos, inclusive militares, para a fundação da cidade de São Sebastião do Rio de Janeiro em 1565, marco dos combates e da expulsão definitiva dos franceses do território brasileiro no século XVI.

Foi marcado pela expansão da pecuária pelo litoral nordestino e região onde atualmente se encontra o estado do Rio Grande do Sul, pela criação do primeiro bispado no Brasil e pela fundação das cidades de Salvador, Rio de Janeiro e São Paulo, hoje a maior da América Latina.