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Determinado projeto de pesquisa prevê análises
transcriptômica, metabolômica e proteômica de uma espécie de
organismos unicelulares, bem como a caracterização
metagenômica do ambiente de ocorrência natural dessa espécie.
Durante o preparo para as análises, as células foram mantidas em
duas condições diferentes, denominadas A e B. O estudo
morfológico dos microrganismos mostrou que o tamanho celular
médio é de 15 µm, com células nucleadas e elevada
complexidade de organelas citoplasmáticas.
Considerando as informações precedentes, julgue o item que se segue.
Microarrays são a principal ferramenta para análise de dados metagenômicos.
Determinado projeto de pesquisa prevê análises
transcriptômica, metabolômica e proteômica de uma espécie de
organismos unicelulares, bem como a caracterização
metagenômica do ambiente de ocorrência natural dessa espécie.
Durante o preparo para as análises, as células foram mantidas em
duas condições diferentes, denominadas A e B. O estudo
morfológico dos microrganismos mostrou que o tamanho celular
médio é de 15 µm, com células nucleadas e elevada
complexidade de organelas citoplasmáticas.
Considerando as informações precedentes, julgue o item que se segue.
A detecção de modificações pós-traducionais em enzimas regulatórias pode elucidar possíveis diferenças nas abundâncias de metabólitos, mesmo que as abundâncias das enzimas não estejam alteradas.
Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômica compartiva por LC-MS/MS. O banco de dados utilizado para a identificação de proteínas continha todas as sequências conhecidas da família taxonômica da espécie A.
A partir dessa situação hipotética, julgue o item a seguir.
Se a abordagem utilizada for do tipo SRM (selected reaction monitoring), será feito o monitoramento de transições predefinidas de íons, adequado para a validação de alvos específicos identificados previamente.
Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômica compartiva por LC-MS/MS. O banco de dados utilizado para a identificação de proteínas continha todas as sequências conhecidas da família taxonômica da espécie A.
A partir dessa situação hipotética, julgue o item a seguir.
A quantificação de proteínas no referido estudo depende da comparação da massa molecular da soma dos íons detectados e da massa molecular da proteína presente no banco de dados.
Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômica compartiva por LC-MS/MS. O banco de dados utilizado para a identificação de proteínas continha todas as sequências conhecidas da família taxonômica da espécie A.
A partir dessa situação hipotética, julgue o item a seguir.
Espera-se encontrar sequências redundantes no banco de dados utilizado.
Em um estudo comparativo entre uma planta nativa (espécie A) e uma geneticamente modificada a partir da espécie A, com deleção de um único gene, foi realizada uma análise proteômica compartiva por LC-MS/MS. O banco de dados utilizado para a identificação de proteínas continha todas as sequências conhecidas da família taxonômica da espécie A.
A partir dessa situação hipotética, julgue o item a seguir.
Na situação em questão, espera-se encontrar diferença de abundância em uma única proteína, na análise proteômica de descoberta.
(1) Miligrama de bioinsumo produzido em 1 h por kg de massa fúngica úmida.
(2) Gene heterólogo e gene marcador de seleção para via metabólica essencial.
(3) Deleção de sítio alostérico em enzima alvo de retroalimentação negativa.
Partindo das informações apresentadas na tabela acima e considerando os conhecimentos acerca do desenvolvimento e da aplicação de bioinsumos, julgue o item que se segue.
O sistema CRISPR-cas utilizando-se apenas RNAs sintéticos, associado ao cultivo de célula única, possibilita a geração de mutantes, como a mutante 3, sem a permanência de elementos transgênicos.
(1) Miligrama de bioinsumo produzido em 1 h por kg de massa fúngica úmida.
(2) Gene heterólogo e gene marcador de seleção para via metabólica essencial.
(3) Deleção de sítio alostérico em enzima alvo de retroalimentação negativa.
Partindo das informações apresentadas na tabela acima e considerando os conhecimentos acerca do desenvolvimento e da aplicação de bioinsumos, julgue o item que se segue.
A caracterização, o entendimento e a replicação dos fenótipos do mutante 1 são dificultados por estarem associados a mudanças em diferentes loci, gerando múltiplas e novas condições regulatórias e metabólicas.
(1) Miligrama de bioinsumo produzido em 1 h por kg de massa fúngica úmida.
(2) Gene heterólogo e gene marcador de seleção para via metabólica essencial.
(3) Deleção de sítio alostérico em enzima alvo de retroalimentação negativa.
Partindo das informações apresentadas na tabela acima e considerando os conhecimentos acerca do desenvolvimento e da aplicação de bioinsumos, julgue o item que se segue.
O cocultivo de diferentes isolados, linhagens e espécies microbianas é dependente de sistemas que permitam a manutenção de cada microrganismo diferente em compartimentos exclusivos, limitando o processo de quorum sensing microbiano e a obtenção de bioprodutos.
O gráfico acima apresenta os dados de crescimento bacteriano em sistema fechado (batelada) de diferentes isolados e linhagens. Os cinco cultivos foram realizados simultaneamente, em frascos separados e nas mesmas condições de espaço, volume, temperatura, agitação e meio de cultivo. A aferição do crescimento foi realizada a cada hora, no período total de 24 h, pela medição da turbidez do meio de cultivo líquido no comprimento de ondas de 600 nm. Os isolados selvagens A, B e C são da mesma espécie, mas foram obtidos de solos de diferentes regiões do Brasil. Após o sequenciamento e a comparação dos genomas dos 3 isolados, foi identificada uma deleção de 3 aminoácidos no sítio ativo da enzima X do isolado A e a inserção de um transposon na região 3` do gene codificante de uma bomba de H+ (prótons) da membrana citoplasmática do isolado B. O isolado C foi modificado por engenharia genética com a deleção dos mesmos 3 aminoácidos que são ausentes no sítio ativo da enzima X do isolado A, gerando a linhagem mutante D. O isolado C também foi modificado com a inserção do transposon observado no isolado B, no mesmo locus, gerando a linhagem mutante E.
Considerando as informações contidas no gráfico e no texto anteriormente apresentados, julgue o item seguinte.
Nas condições de isolamento e cultivo em aerobiose, utilizadas para gerar os dados do gráfico, não seriam obtidas espécies fixadoras de nitrogênio como Rhizobium ssp. e Mesorhizobium spp., pois esses gêneros estão associados em simbiose anaeróbia com nódulos radiculares de leguminosas.
O gráfico acima apresenta os dados de crescimento bacteriano em sistema fechado (batelada) de diferentes isolados e linhagens. Os cinco cultivos foram realizados simultaneamente, em frascos separados e nas mesmas condições de espaço, volume, temperatura, agitação e meio de cultivo. A aferição do crescimento foi realizada a cada hora, no período total de 24 h, pela medição da turbidez do meio de cultivo líquido no comprimento de ondas de 600 nm. Os isolados selvagens A, B e C são da mesma espécie, mas foram obtidos de solos de diferentes regiões do Brasil. Após o sequenciamento e a comparação dos genomas dos 3 isolados, foi identificada uma deleção de 3 aminoácidos no sítio ativo da enzima X do isolado A e a inserção de um transposon na região 3` do gene codificante de uma bomba de H+ (prótons) da membrana citoplasmática do isolado B. O isolado C foi modificado por engenharia genética com a deleção dos mesmos 3 aminoácidos que são ausentes no sítio ativo da enzima X do isolado A, gerando a linhagem mutante D. O isolado C também foi modificado com a inserção do transposon observado no isolado B, no mesmo locus, gerando a linhagem mutante E.
Considerando as informações contidas no gráfico e no texto anteriormente apresentados, julgue o item seguinte.
Entre os novos métodos de sequenciamento de ácidos nucleicos (NGS), o uso de nanoporos com leituras longas, devido à maior cobertura vertical e profundidade, seria o mais indicado para proceder à triagem metagenômica dos três diferentes solos e identificar as variações nos isolados A e B.
O gráfico acima apresenta os dados de crescimento bacteriano em sistema fechado (batelada) de diferentes isolados e linhagens. Os cinco cultivos foram realizados simultaneamente, em frascos separados e nas mesmas condições de espaço, volume, temperatura, agitação e meio de cultivo. A aferição do crescimento foi realizada a cada hora, no período total de 24 h, pela medição da turbidez do meio de cultivo líquido no comprimento de ondas de 600 nm. Os isolados selvagens A, B e C são da mesma espécie, mas foram obtidos de solos de diferentes regiões do Brasil. Após o sequenciamento e a comparação dos genomas dos 3 isolados, foi identificada uma deleção de 3 aminoácidos no sítio ativo da enzima X do isolado A e a inserção de um transposon na região 3` do gene codificante de uma bomba de H+ (prótons) da membrana citoplasmática do isolado B. O isolado C foi modificado por engenharia genética com a deleção dos mesmos 3 aminoácidos que são ausentes no sítio ativo da enzima X do isolado A, gerando a linhagem mutante D. O isolado C também foi modificado com a inserção do transposon observado no isolado B, no mesmo locus, gerando a linhagem mutante E.
Considerando as informações contidas no gráfico e no texto anteriormente apresentados, julgue o item seguinte.
A identificação dos isolados A, B, C e suas variações genômicas poderia ser antecipada em uma bioprospecção metagenômica, mas as características fenotípicas observadas no gráfico são específicas de cada cultura pura em seu ambiente experimental.
O gráfico acima apresenta os dados de crescimento bacteriano em sistema fechado (batelada) de diferentes isolados e linhagens. Os cinco cultivos foram realizados simultaneamente, em frascos separados e nas mesmas condições de espaço, volume, temperatura, agitação e meio de cultivo. A aferição do crescimento foi realizada a cada hora, no período total de 24 h, pela medição da turbidez do meio de cultivo líquido no comprimento de ondas de 600 nm. Os isolados selvagens A, B e C são da mesma espécie, mas foram obtidos de solos de diferentes regiões do Brasil. Após o sequenciamento e a comparação dos genomas dos 3 isolados, foi identificada uma deleção de 3 aminoácidos no sítio ativo da enzima X do isolado A e a inserção de um transposon na região 3` do gene codificante de uma bomba de H+ (prótons) da membrana citoplasmática do isolado B. O isolado C foi modificado por engenharia genética com a deleção dos mesmos 3 aminoácidos que são ausentes no sítio ativo da enzima X do isolado A, gerando a linhagem mutante D. O isolado C também foi modificado com a inserção do transposon observado no isolado B, no mesmo locus, gerando a linhagem mutante E.
Considerando as informações contidas no gráfico e no texto anteriormente apresentados, julgue o item seguinte.
A caracterização do elemento genético móvel do isolado B pode restringir sua aplicação como bioinsumo, caso aquele elemento seja classificado como integrativo e conjugativo.
Julgue o próximo item, pertinente à utilização de recursos genéticos.
O conceito moderno de recursos genéticos se refere às espécies animais, vegetais e microbianas, aquáticas e terrestres, que foram desenvolvidas e melhoradas e que têm apenas valor econômico e científico em um país.
Julgue o item que se segue, pertinente a genética molecular.
A genética molecular pode ser utilizada para fazer que genes estranhos sejam expressos em bactérias e leveduras ou mesmo em outras células superiores.
A respeito da conservação de recursos genéticos de origem animal, julgue o item a seguir.
A conservação in situ é recomendada em unidades de conservação de proteção integral, pois facilita o processo de evolução e de adaptação contínua de uma espécie.
Tendo o texto precedente como referência inicial, julgue o próximo item, relativo ao ensaio ATAC-Seq.
O ensaio ATAC-Seq permite identificar sequências de DNA localizadas na região adjacente à extremidade 5' do gene, antes da região codificante.
Tendo o texto precedente como referência inicial, julgue o próximo item, relativo ao ensaio ATAC-Seq.
O perfil de acessibilidade da cromatina traduz a disponibilidade de um trecho de DNA para reguladores de expressão gênica.
Tendo o texto precedente como referência inicial, julgue o próximo item, relativo ao ensaio ATAC-Seq.
A reação de amplificação citada no texto em questão é repetida ciclicamente por meio de uma série de alterações de temperatura, o que possibilita a produção de muitas cópias de fragmentos específicos de DNA.
Em células diferenciadas, a cromatina é espacialmente segregada em regiões cromossômicas. Durante a interfase, é possível observar duas configurações diferentes da cromatina, a eucromatina e a heterocromatina, duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis. A heterocromatina é categorizada em heterocromatina facultativa e constitutiva.
Acerca das duas formas estrutural e funcionalmente distinguíveis da cromatina, julgue o item subsequente.
Em células diferenciadas, a eucromatina consiste em domínios transcricionalmente silenciosos, o que permite que elementos genéticos móveis sejam transcritos.
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