Questões de Concurso para FUVEST

Q3303925

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Engenheiro (especialidade: Arborização Urbana e Manejo Arbóreo) |

Q3303925 Engenharia Ambiental e Sanitária

Você é chamado para elaborar um laudo e manifestação técnica para fundamentar a necessidade de manejo da vegetação de porte arbóreo. Nesse caso, esse laudo e manifestação técnica, de acordo com a legislação em vigor, deverão conter, entre outros:

A

a identificação de cada um dos espécimes avaliados, o georreferenciamento e a justificativa da necessidade de intervenção.

B

as pesquisas científicas mais avançadas sobre os riscos e benefícios do espécime, inclusive com referências nacionais e internacionais.

C

o croqui indicativo do lugar de plantio no caso de transplante, plantio substitutivo ou regeneração de espécies.

D

a identificação das espécies exóticas e invasoras, bem como da situação do espécime ameaçado de extinção, descrevendo a situação do local a ser manejado.

E

a documentação fotográfica das edificações e elementos urbanos existentes no imóvel e áreas do entorno.

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Q3303924

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Engenheiro (especialidade: Arborização Urbana e Manejo Arbóreo) |

Q3303924 Meio Ambiente

No Campus da USP, na cidade de São Paulo, o Poder Público poderá autorizar supressão e o transplante de espécimes de vegetação de porte arbóreo:

A

quando o espécime de vegetação de porte arbóreo frutífero constituir obstáculo a limpeza do espaço público.

B

quando o estado fitossanitário do espécime de vegetação de porte arbóreo justificar a supressão.

C

quando o espécime de vegetação de porte arbóreo constituir obstáculo contornável ao trânsito de pedestres.

D

quando o estado do espécime arbóreo não ocasionar risco de queda.

E

quando a propagação espontânea de espécimes de porte arbóreo possibilitar o desenvolvimento adequado dos espécimes vizinhos.

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Q3303923

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Engenheiro (especialidade: Arborização Urbana e Manejo Arbóreo) |

Q3303923 Legislação Municipal

Em relação aos critérios e procedimentos para o manejo da arborização urbana:

A

o plantio de espécimes de vegetação de porte arbóreo em áreas públicas ou privadas, poderá ser efetuado em caráter de reparação e/ou compensação, e independe de autorização da autoridade pública competente.

B

caberá ao proprietário ou ao possuidor do imóvel onde estiver inserida a vegetação de porte arbóreo providenciar o manejo necessário dos espécimes quando caracterizada a situação de urgência, quer dizer, risco de queda, colocando em risco a vida e integridade física de pessoas ou o patrimônio público ou privado.

C

ao ser identificado o plantio de espécime arbóreo, executado em desacordo com as normas vigentes, a autoridade competente deve intimar o proprietário do imóvel lindeiro à via ou ao passeio onde esse espécime arbóreo se encontra, para que, no prazo de 7 (sete) dias, regularize-o, inclusive executando a supressão, se necessário.

D

o plantio de espécimes de vegetação de porte arbóreo tem em vista assegurar o pleno desenvolvimento da cidade, não sendo, entretanto, recomendado tal plantio em passeios em largura menor que 2,75m (dois metros e setenta e cinco centímetros).

E

o proprietário poderá executar qualquer poda na vegetação de porte arbóreo existente em seu imóvel, sem a necessidade de previamente comunicar o órgão municipal competente.

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Q3303922

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Engenheiro (especialidade: Arborização Urbana e Manejo Arbóreo) |

Q3303922 Direito Ambiental

Ao supervisionar um projeto de engenharia, você precisa esclarecer a sua equipe sobre o conceito e tipologia das áreas de preservação permanente (APPs), previstas na Lei federal n. 12.651/2012 (“Novo Código Florestal”). Nesse sentido você esclarece à equipe que as APPs:

A

são cobertas por vegetação nativa, com a função ambiental de preservar os recursos hídricos e a biodiversidade, impedir o fluxo gênico de fauna e flora, proteger o solo e assegurar o bem-estar das populações humanas.

B

estão presentes em zonas urbanas, sendo que as Reservas Legais estão presentes em zonas urbanas e rurais.

C

podem estar localizadas ao longo das faixas marginais de qualquer curso d’água natural perene e intermitente, excluídos os efêmeros, sendo que sua largura mínima é fixada desde a borda da calha do leito regular, de acordo com o previsto nessa lei.

D

em áreas urbanas consolidadas, lei municipal não pode definir faixas marginais distintas das estabelecidas e fixadas pelo “Novo Código Florestal”, visto que se trata de uma norma geral.

E

declaradas por ato do Chefe do Poder Executivo são aquelas estabelecidas com o intuito de possibilitar o cálculo dos percentuais da Reserva Legal.

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Q3303921

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Engenheiro (especialidade: Arborização Urbana e Manejo Arbóreo) |

Q3303921 Direito Ambiental

No Estado de São Paulo a política florestal deve observar os ditames da política nacional do meio ambiente e do “Novo Código Florestal” que são considerados como norma geral e estabelecem entre seus princípios e objetivos:¬

A

a primazia da preservação ambiental e das florestas em relação ao desenvolvimento econômico e social.

B

a preservação e restauração dos recursos florestais, dentre os quais se inserem as florestas, para a sua utilização exclusivamente econômica.

C

a imposição ao poluidor de arcar com os custos da indenização dos danos causados às florestas, sem a obrigação de recuperá-las.

D

afirmação do compromisso soberano do Brasil com a preservação das suas florestas e demais formas de vegetação nativa, da biodiversidade, do solo, dos recursos hídricos e da integridade do sistema climático, para o bemestar das gerações presentes e futuras.

E

a definição de áreas prioritárias de ação governamental relativa à qualidade e ao equilíbrio ecológico, atendendo prioritariamente aos interesses da União para a preservação das florestas em razão de seu compromisso soberano com o combate aos efeitos cada vez mais intensos e frequentes da mudança climática.

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Q3303920

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Engenheiro (especialidade: Arborização Urbana e Manejo Arbóreo) |

Q3303920 Direito Ambiental

Todos têm direito ao meio ambiente ecologicamente equilibrado, bem de uso comum do povo e essencial à sadia qualidade de vida, impondo-se ao Poder Público e à coletividade o dever de defendê-lo e preservá-lo para as presentes e futuras gerações” (artigo 225, caput do texto constitucional de 1988). Para tanto, incumbe ao Poder Público:

A

preservar e restaurar os processos ecológicos secundários e promover o manejo ecológico dos biomas.

B

preservar a diversidade e a integridade do patrimônio genético do País e fiscalizar as entidades dedicadas à pesquisa e manipulação de material genético.

C

definir espaços territoriais e seus componentes a serem especialmente protegidos, sendo que a alteração e supressão pode ser realizada por lei ou decreto.

D

exigir para instalação de obra ou atividade potencialmente causadora de significativa degradação do meio ambiente, estudo prévio de impacto ambiental, que deverá manterse em sigilo em razão dos interesses econômicos do proponente.

E

promover a educação ambiental nas universidades e a conscientização pública para a preservação do meio ambiente.

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Q3303058

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303058 Programação

Na Bioinformática, a manipulação e a análise de grandes volumes de dados exigem ferramentas eficientes e bem estruturadas. No R, pacotes como Bioconductor fornecem funcionalidades específicas para análise de dados ômicos, enquanto o Tidyverse facilita a manipulação de tabelas. No Python, bibliotecas como Pandas e NumPy permitem a manipulação de DataFrames e arrays de forma otimizada, essenciais para explorar e processar conjuntos de dados biológicos. Além disso, a escolha de boas práticas e ferramentas impacta diretamente a eficiência, transparência e reprodutibilidade das análises. Qual das alternativas a seguir representa corretamente uma vantagem do uso de Pandas e NumPy na manipulação de dados biológicos?

A

O Pandas permite manipular dados apenas em pequenos conjuntos, tornando-se ineficiente para grandes volumes de informações biológicas.

B

O Pandas oferece estruturas como DataFrames, permitindo manipular grandes conjuntos de dados biológicos de maneira eficiente, enquanto o NumPy fornece operações vetorizadas para cálculos matemáticos otimizados.

C

O NumPy substitui completamente o Pandas em todas as análises biológicas, pois sua estrutura de arrays multidimensionais é suficiente para qualquer tipo de manipulação de dados.

D

O Pandas realiza todas as operações matemáticas automaticamente, dispensando a necessidade de manipular arrays ou aplicar métodos estatísticos adicionais.

E

O NumPy e o Pandas foram desenvolvidos exclusivamente para aplicações bioinformáticas, não sendo amplamente utilizados em outras áreas da ciência de dados.

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Q3303057

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303057 Biologia

Repositórios públicos de dados ômicos permitem o armazenamento e compartilhamento de dados gerados em pesquisas biomédicas. Esses bancos de dados disponibilizam informações em diferentes níveis de processamento, permitindo que pesquisadores realizem novas análises e validem descobertas. Assinale a alternativa que descreve corretamente como o depósito de dados nesses repositórios contribui para a reprodutibilidade e integridade da pesquisa científica.

A

O depósito de dados no GEO e no SRA permite que outros pesquisadores acessem, reavaliem e comparem conjuntos de dados, garantindo a transparência dos experimentos e possibilitando novas descobertas a partir de reanálises.

B

Como as análises de expressão gênica são altamente específicas para cada experimento, a reutilização de dados depositados no GEO e SRA é limitada, tornando a submissão opcional e sem impacto significativo na reprodutibilidade científica.

C

exigência de metadados nos repositórios GEO e SRA se restringe à descrição técnica da plataforma de sequenciamento utilizada, não sendo necessária a inclusão de informações experimentais detalhadas.

D

Dados depositados no GEO e no SRA devem ser acessados exclusivamente pelos autores originais do estudo, garantindo que apenas os pesquisadores envolvidos possam manipular as informações e prevenir interpretações equivocadas.

E

O armazenamento de dados brutos em repositórios como GEO e SRA tem impacto mínimo na ciência aberta, pois os arquivos são de difícil interpretação sem os scripts exatos utilizados para processamento.

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Q3303056

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303056 Biologia

A extração de ácidos nucleicos é uma etapa fundamental para diversas aplicações em biologia molecular, como PCR, qPCR e sequenciamento de RNA (RNA-seq). A escolha do método apropriado deve considerar fatores como pureza, integridade e concentração do material extraído. Além disso, a presença de contaminantes, como proteínas ou solventes orgânicos, pode interferir na qualidade das análises subsequentes. Para garantir resultados confiáveis, diversas estratégias de controle de qualidade são empregadas, como espectrofotometria, eletroforese e fluorimetria. Assinale a estratégia mais apropriada para garantir a qualidade do RNA extraído antes de análises transcriptômicas.

A

Armazenar o RNA em temperatura ambiente logo após a extração, pois isso evita a formação de complexos com proteínas que poderiam comprometer a pureza.

B

Avaliar a integridade do RNA por eletroforese em gel de agarose ou em um bioanalisador, verificando a razão entre os rRNAs 18S e 28S, além de medir a razão 260/280 para detectar contaminantes proteicos.

C

Utilizar apenas o espectrofotômetro para medir a concentração do RNA, sem necessidade de testes adicionais, já que a absorbância em 260 nm é suficiente para avaliar a qualidade da amostra.

D

Aplicar reagentes inibidores de RNases apenas após a conversão do RNA em cDNA, pois nesse estágio a molécula já está estabilizada para análises subsequentes.

E

Empregar a precipitação com etanol como único método de purificação, sem realizar lavagens adicionais, pois esse processo remove todas as impurezas automaticamente.

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Q3303055

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303055 Noções de Informática

O aprendizado de máquina é amplamente aplicado na Bioinformática para analisar grandes volumes de dados biológicos, identificar padrões e realizar previsões. Métodos como classificação, clustering e redução de dimensionalidade são empregados para revelar estruturas subjacentes nos dados e facilitar a interpretação de fenômenos biológicos complexos. Técnicas como PCA (Análise de Componentes Principais), tSNE e UMAP são utilizadas para reduzir a dimensionalidade e visualizar agrupamentos naturais. Assinale a alternativa que representa uma aplicação adequada da redução de dimensionalidade em análises ômicas.

A

O PCA é um método não supervisionado usado exclusivamente para classificar amostras em categorias previamente conhecidas.

B

O t-SNE e o UMAP realizam clustering diretamente, separando amostras em grupos fixos sem necessidade de algoritmos adicionais.

C

Métodos de redução de dimensionalidade, como PCA, t-SNE e UMAP, auxiliam na visualização e na identificação de padrões em grandes conjuntos de dados biológicos, reduzindo a complexidade dos dados sem descartar informações essenciais.

D

A redução de dimensionalidade é necessária apenas quando o número de amostras é muito maior que o número de variáveis, tornando-a irrelevante na maioria das análises de expressão gênica.

E

A aplicação de aprendizado de máquina na Bioinformática dispensa a necessidade de técnicas de redução de dimensionalidade, pois os modelos modernos lidam eficientemente com dados de alta dimensionalidade sem perda de desempenho.

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Q3303054

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303054 Engenharia de Software

A reprodutibilidade é um princípio essencial em Bioinformática, permitindo que análises sejam repetidas com os mesmos dados e ferramentas em diferentes ambientes. Diversas estratégias podem ser adotadas para minimizar variações na execução de pipelines. Diante desse cenário, qual das abordagens a seguir representa a melhor estratégia para garantir a reprodutibilidade de um pipeline bioinformático?

A

Executar os scripts manualmente sempre que necessário, garantindo que cada etapa seja revisada antes da execução para minimizar erros.

B

Utilizar Snakemake ou Nextflow para estruturar workflows automatizados e empregar contêineres como Docker ou Singularity para padronizar o ambiente de execução.

C

Rodar o pipeline em um único computador sem conexão com a internet, garantindo que as versões das ferramentas permaneçam fixas ao longo do tempo.

D

Configurar todas as dependências manualmente e anotar versões de software em um arquivo de texto, permitindo que usuários repliquem a instalação em suas máquinas.

E

Depender exclusivamente de clusters computacionais institucionais, pois esses ambientes são configurados para sempre fornecer as mesmas versões de ferramentas para qualquer usuário.

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Q3303053

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303053 Biomedicina - Análises Clínicas

A análise multiômica combina diferentes camadas de dados biológicos, como transcriptômica, proteômica, metabolômica e microbiômica, para obter uma visão mais abrangente dos fenômenos celulares e fisiológicos. No entanto, a integração desses dados apresenta desafios computacionais e estatísticos significativos, especialmente ao tentar correlacionar diferentes tipos de informações geradas por técnicas distintas. Métodos baseados em redes de interação e aprendizado de máquina têm sido amplamente explorados para facilitar essa integração e revelar padrões biológicos complexos. Assinale a abordagem que representa corretamente um método eficiente para integração e análise de dados multiômicos.

A

A análise multiômica pode ser realizada simplesmente combinando os valores brutos de expressão de diferentes camadas (transcriptômica, proteômica, metabolômica) sem necessidade de normalização ou ajustes estatísticos.

B

Como os dados proteômicos e transcriptômicos frequentemente apresentam correlação direta, a modelagem multiômica pode ser baseada unicamente na expressão gênica sem necessidade de avaliar os níveis de proteína ou metabólitos.

C

Métodos de integração de larga escala não são adequados para estudos multiômicos, pois cada tipo de dado requer uma análise específica e não pode ser comparado diretamente.

D

A integração multiômica pode ser realizada por meio de redes de interação molecular, que correlacionam dados de diferentes camadas usando métodos estatísticos e aprendizado de máquina para identificar padrões biológicos relevantes.

E

A análise multiômica é inviável para a maioria dos estudos biológicos devido à incompatibilidade técnica entre as diferentes plataformas de sequenciamento e espectrometria de massas.

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Q3303052

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303052 Biologia

A análise de RNA-seq envolve múltiplas etapas, incluindo mapeamento de leituras, quantificação, normalização e análise estatística de expressão diferencial. O mapeamento eficiente de sequências contra um genoma de referência pode impactar diretamente a precisão dos resultados, assim como a escolha de métodos de quantificação e normalização. Ferramentas como STAR e HISAT2 realizam alinhamento, enquanto Salmon emprega um modelo livre de alinhamento para quantificação. Da mesma forma, pacotes estatísticos como DESeq2, edgeR e limma são amplamente utilizados para normalizar e identificar genes diferencialmente expressos. Qual abordagem melhor representa as vantagens e limitações das diferentes metodologias de análise de RNAseq?

A

O STAR e o HISAT2 são equivalentes em desempenho e sempre retornam os mesmos resultados, independentemente das características da amostra ou do genoma de referência.

B

O STAR e o HISAT2 utilizam estratégias de mapeamento distintas, sendo que o STAR é mais rápido devido ao seu algoritmo baseado em índices do tipo suffix array, enquanto o HISAT2 apresenta melhor desempenho em genomas altamente polimórficos.

C

A quantificação via Salmon, por não utilizar alinhamento tradicional, compromete a precisão dos resultados ao estimar a expressão gênica de forma indireta, tornando-o inviável para análises robustas.

D

O DESeq2 e o edgeR utilizam métodos idênticos de normalização de contagens, tornando sua escolha irrelevante para a análise de expressão diferencial.

E

A normalização em análises de RNA-seq é dispensável, pois a contagem absoluta de transcritos já representa fielmente a expressão gênica em todas as amostras analisadas.

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Q3303051

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303051 Biologia

A análise de variantes genômicas é um processo essencial em estudos de genética e genômica clínica, sendo composta por etapas como alinhamento de leituras, detecção de SNPs/INDELs, anotação e interpretação das variantes. Ferramentas como BWA, Bowtie, GATK, bcftools, ANNOVAR e VEP desempenham papéis fundamentais nesse pipeline. A escolha adequada dessas ferramentas pode impactar diretamente a qualidade dos resultados obtidos. Assinale a alternativa que descreve corretamente a importância da anotação de variantes em um estudo genômico.

A

A anotação de variantes consiste apenas na comparação das mutações identificadas com um banco de dados de polimorfismos genéticos, sem qualquer análise funcional associada.

B

A anotação de variantes permite associar mutações identificadas a possíveis impactos funcionais, como alterações na estrutura proteica ou regulação da expressão gênica, sendo essencial para a interpretação clínica dos achados.

C

Ferramentas de anotação, como ANNOVAR e VEP, determinam automaticamente se uma variante é patogênica ou benigna, eliminando a necessidade de validação experimental.

D

O processo de anotação se restringe a relatar se uma variante ocorre em uma região codificante do genoma, sem fornecer informações sobre possíveis consequências biológicas.

E

A anotação de variantes é um processo independente da detecção de SNPs e INDELs, não afetando a priorização de variantes em estudos de associação genética.

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Q3303050

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303050 Biologia

A análise in silico de proteínas envolve diferentes abordagens para prever e interpretar suas estruturas e interações funcionais. Entre essas abordagens, destacam-se a modelagem comparativa, a predição ab initio, a análise de dinâmica molecular e o docking molecular. Ferramentas computacionais modernas auxiliam na interpretação dos resultados dessas análises, permitindo aplicações em descoberta de fármacos, design de proteínas e bioquímica estrutural. Assinale a alternativa que apresenta corretamente a principal característica da modelagem comparativa de proteínas.

A

A modelagem comparativa de proteínas usa exclusivamente informações genômicas para prever a estrutura tridimensional de uma proteína sem necessidade de estrutura conhecida de referência.

B

Na modelagem comparativa, estruturas de proteínas conhecidas são usadas como referência para prever a estrutura de uma proteína desconhecida, sendo mais precisa quanto maior a identidade de sequência entre a proteína-alvo e a proteína modelo.

C

A modelagem comparativa é baseada na ideia de que proteínas de organismos distintos sempre compartilham estruturas idênticas, independentemente de diferenças na sequência de aminoácidos.

D

Métodos de modelagem comparativa são superiores aos baseados em aprendizado profundo, como AlphaFold, pois não dependem de grandes bancos de dados estruturais para gerar previsões precisas.

E

Modelos obtidos por modelagem comparativa não necessitam de refinamento ou validação experimental, uma vez que são construídos diretamente a partir de estruturas cristalográficas de proteínas conhecidas.

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Q3303049

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303049 Biologia

A integração de diferentes camadas de dados ômicos, como genômica, transcriptômica, proteômica e metabolômica, é um desafio fundamental na biologia de sistemas. Um dos obstáculos é a alta dimensionalidade dos dados, o que pode dificultar a interpretação e levar a correlações espúrias. Estratégias como a redução de dimensionalidade (por exemplo: PCA), correlação entre dados distintos e a construção de redes de interação ajudam a identificar padrões biológicos significativos e inferir relações funcionais entre genes, proteínas e metabólitos. Diante desse contexto, qual das alternativas a seguir apresenta corretamente um benefício da construção de redes de coexpressão gênica na integração de dados multiômicos?

A

A construção de redes de coexpressão gênica permite identificar módulos funcionais, agrupando genes que apresentam padrões de expressão correlacionados, o que pode sugerir regulação compartilhada e participação em vias biológicas específicas.

B

análise de redes de coexpressão reduz automaticamente a dimensionalidade dos dados, eliminando genes não expressos e garantindo que todos os genes no módulo tenham papel funcional relevante.

C

Redes de coexpressão gênica garantem que genes altamente expressos sejam priorizados nas análises, uma vez que a abundância de transcritos é o principal fator determinante para a funcionalidade biológica.

D

A utilização de redes de coexpressão evita a necessidade de análises estatísticas adicionais, pois os genes agrupados em um mesmo módulo necessariamente interagem fisicamente entre si.

E

Em redes de coexpressão, a inclusão de dados metabolômicos ou proteômicos não influencia os resultados, pois a regulação gênica ocorre apenas no nível da transcrição, sem necessidade de outras camadas de informação.

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Q3303048

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303048 Biomedicina - Análises Clínicas

Software como Progenesis e Protein Lynx Global Service (PLGS) são amplamente utilizados no processamento de dados de espectrometria de massas para proteômica e metabolômica. Essas ferramentas realizam etapas críticas, como alinhamento de picos, normalização, identificação de proteínas ou metabólitos e quantificação relativa entre amostras experimentais. Entretanto, a confiabilidade dos resultados depende de uma série de parâmetros e estratégias de controle de qualidade para reduzir falsos positivos e melhorar a interpretação biológica dos dados. Diante desse contexto, qual das alternativas apresenta corretamente uma estratégia fundamental para garantir a precisão dos resultados na análise proteômica e metabolômica utilizando PLGS ou Progenesis?

A

A utilização exclusiva de bancos de dados de referência, sem permitir a busca de variantes ou modificações pós-traducionais, reduz a taxa de falsos positivos e melhora a acurácia da análise.

B

O uso de filtros estatísticos rígidos, como a remoção de todas as identificações com FDR (False Discovery Rate) superior a 5%, pode comprometer a detecção de biomarcadores de baixa abundância, mas não influencia significativamente a qualidade dos resultados.

C

A normalização dos dados antes da comparação entre amostras não é necessária, pois software como PLGS e Progenesis já realizam ajustes automáticos para minimizar variações experimentais.

D

O uso de tolerâncias de massa muito restritivas na pesquisa de espectros de massas sempre melhora a precisão das identificações, pois evita a atribuição errônea de fragmentos peptídicos ou metabólicos

E

A aplicação de estratégias combinadas, como normalização de intensidades, controle de taxa de erro (FDR), verificação manual de espectros e validação experimental das proteínas/metabólitos mais relevantes, é essencial para garantir a confiabilidade dos resultados.

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Q3303047

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303047 Biologia

Software de análise ômica, como Cytoscape, String, ClueGO, Reactome e KEGG, permitem a interpretação integrada de grandes volumes de dados biológicos. Esses programas auxiliam na visualização de redes de interação molecular, enriquecimento funcional e associação de genes a vias metabólicas e processos celulares. A correta aplicação dessas ferramentas melhora a inferência de mecanismos biológicos subjacentes a diferentes fenótipos observados. Qual é a alternativa que melhor descreve a aplicação de um desses software na análise de dados ômicos?

A

String é um software usado exclusivamente para análise de expressão gênica diferencial, permitindo comparar a abundância de transcritos entre diferentes condições experimentais.

B

KEGG é um software de visualização de redes biológicas que permite prever interações entre proteínas com base em coexpressão gênica e experimentos de ligação molecular.

C

Cytoscape permite identificar exclusivamente proteínas que participam de vias metabólicas, mas não é útil para a análise de redes de interação gênica.

D

Reactome oferece análise de enriquecimento funcional, mas sua base de dados não é atualizada periodicamente, dificultando a integração com dados ômicos recentes.

E

ClueGO é um plugin do Cytoscape que permite a análise integrada de enriquecimento funcional, combinando termos de Gene Ontology (GO) e vias de KEGG, ajudando a interpretar redes de interações moleculares.

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Q3303046

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303046 Biologia

Os dados obtidos em experimentos ômicos podem conter variações técnicas e biológicas que influenciam a análise. Para minimizar esses efeitos, diferentes estratégias são aplicadas antes da interpretação dos resultados. Assinale a alternativa que melhor descreve a importância do pré-processamento e normalização na análise de dados ômicos.

A

O pré-processamento de dados ômicos é dispensável quando se utiliza equipamentos modernos, pois leituras de baixa qualidade não influenciam significativamente a análise.

B

A normalização dos dados transcriptômicos é necessária apenas quando se deseja comparar amostras coletadas em momentos distintos, sendo desnecessária para análises em um único experimento.

C

A filtragem de dados em microbiômica é importante apenas para remover leituras de baixa qualidade, mas não impacta na identificação de espécies microbianas.

D

Em proteômica, a remoção de contaminantes é irrelevante, pois algoritmos de identificação já conseguem distinguir proteínas reais de artefatos experimentais.

E

O pré-processamento de dados ômicos é crucial para reduzir erros, melhorar a reprodutibilidade e evitar vieses, garantindo que a interpretação dos resultados seja confiável.

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Q3303045

Ano: 2025 Banca: FUVEST Órgão: USP Prova: FUVEST - 2025 - USP - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) |

Q3303045 Biologia

Diferentes estratégias de sequenciamento de RNA podem ser aplicadas para capturar distintas classes de moléculas, como mRNAs, pequenos RNAs e lncRNAs. A escolha do protocolo influencia a complexidade da análise, a profundidade da cobertura e a detecção de transcritos raros. Qual é a alternativa que melhor justifica a escolha do sequenciamento de RNA total em vez de um protocolo específico para mRNA, mesmo que isso acarrete maior complexidade analítica?

A

O sequenciamento de RNA total reduz a necessidade de controle de qualidade e normalização dos dados, pois inclui todas as moléculas de RNA sem viés de enriquecimento.

B

A escolha do RNA total é feita exclusivamente quando se pretende obter alta cobertura de genes altamente expressos, sendo desnecessária para a análise de transcritos raros ou regulatórios.

C

O uso de RNA total é preferível apenas quando não há interesse na análise de isoformas ou variantes de splicing, pois sua principal vantagem está na quantidade de dados gerados.

D

A opção pelo sequenciamento de RNA total garante maior profundidade de leitura de mRNAs, melhorando a detecção de isoformas e variantes de splicing.

E

A adoção de RNA total permite analisar uma gama mais ampla de moléculas, incluindo pequenos RNAs e lncRNAs, possibilitando um entendimento mais completo da regulação gênica e da heterogeneidade do transcriptoma.

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