Questões da Prova FGV - 2010 - FIOCRUZ - Tecnologista em Saúde - Genômica Funcional e Sequenciamento de DNA

Um pesquisadora coletou no campo vários indivíduos que ela classificou como pertencentes ao gênero Drosophila, mas sem designar espécies. Após o sequenciamento de uma região gênica, ela alinhou duas sequências, cujo número de diferenças está mostrado na tabela par a par abaixo. As células da diagonal indicam o número de bases idênticas e nas demais células, o número de substituições observáveis na comparação de sequências alinhadas de dois indivíduos. 

                                        

Sobre a tabela, analise as afirmativas a seguir.

I. As sequências pertencem a mesma espécie, pois o número de diferenças entre elas é baixo.

II. As sequências estão evoluindo sob ação da seleção purificadora.

III. Existe um desvio a favor das transições, esperado em regiões gênicas não codificadoras de proteínas.

Assinale: 

Preencha a lacuna corretamente em relação aos algoritmos exaustivos de busca de árvores.

O número de árvores filogenéticas enraizadas possíveis __________ número de sequências analisadas.

Analise as seguintes afirmativas sobre bancos de dados genéticos.

I. Swiss-Prot é um banco manualmente curado não-redundante de proteínas anotadas em detalhes.

II. GenBank é um banco não-curado não-redundante de sequências de DNA.

III. UniGENE é um banco não-curado redundante de sequências de transcritos primários.

Assinale: 

Pongo                         GACACAACCTCA-ACTAGCGG--------ATAAA

Gorilla                         TACTAAGCCTAG-GCCTACTCT-----CTATAAT

Pan paniscus                TATATATCCTGACACTAATACTAA--TAGAAAAA

Pan troglodites             CATCTACCTCCACATTGGTCGCGGT-TTTTACTA

Homo sapiens              CAATCGCTGAGTCACCAATCGCTTC-TCCACCCT

Hylobates                    CTTTCATTACTTAGCAGGTGTTTCCTCCATTCTA

Com base na figura acima, é possível afirmar que as sequências parciais de primatas: 

Sobre o BLAST, analise as afirmativas a seguir.

I. A identificação de sequências pelo BLAST apresenta um problema de circularidade associada a identificação.

II. BLAST fornece uma medida do grau de homologia, isto é ancestralidade comum, entre as duas sequências comparadas.

III. Uma ferramenta comum para inferência de ortologia entre duas sequências de genomas diferentes é usando a ferramenta BBH (Best bi-directional hit, em inglês).

Assinale: