O controle da intensidade do treinamento aeróbio deve ser feito, preferencialmente, com base na frequência cardíaca de reserva.

São recomendados exercícios aeróbios com 60% a 80% da frequência cardíaca máxima. 

Deve-se realizar o treinamento aeróbio mantendo a frequência cardíaca do paciente próximo ao limite inferior da zona alvo de treinamento.

Durante o treinamento aeróbio, a aplicação da ventilação mecânica não-invasiva (VNI) possibilita maior oferta de oxigênio à musculatura periférica ativa.

Para o controle de intensidade do exercício, pode ser utilizado a Escala de Borg, preferencialmente a escala modificada, em que a sensação de dispneia do paciente deve se manter entre os níveis 6 e 7 durante o treinamento.