No exame de imagem, a ausência de dilatação do ducto biliar exclui o diagnóstico de colangite.

A avaliação não-invasiva por imagem do fígado e da árvore biliar é mandatória em todos os pacientes com evidência bioquímica de colestase.

A colangioressonância por ressonância magnética é um exame seguro e com acurácia para detecção de estenose e dilatação de ductos intra- e extra-hepáticos, porém não é indicado se há suspeita clínica de colangite esclerosante primária ou secundária.

No início do curso da doença, a CBP é caracterizada por níveis séricos elevados de bilirrubina e diminuição da albumina sérica, enquanto que, no curso mais tardio da doença, há níveis séricos elevados de FA e gama glutamil transferase (GGT), sendo considerados como importantes marcadores.

Em pacientes com colestase intra-hepática crônica, a pesquisa de anticorpos antimitocondriais é inútil para confirmação diagnóstica.