O Método Canguru possui três etapas de aplicabilidade até que os recém-nascidos sejam avaliados e encaminhados para acompanhamento em ambulatórios de seguimento ou de reabilitação. Na segunda etapa, o recém-nascido permanece de maneira contínua com sua mãe e a posição canguru será realizada pelo maior tempo possível. A presença e a participação do pai nos cuidados devem ser estimuladas. São critérios de elegibilidade para esta etapa: