Cavalos infectados podem apresentar uma síndrome febril aguda, com trombocitopenia e/ou anemia; uma síndrome subaguda ou crônica de febre recrudescente, perda de peso, edema ventral e anemia mais severa; ou podem parecer clinicamente normais.

O vírus da AIE é transmitido entre equídeos infectados e não infectados pela transferência de sangue ou derivados sanguíneos. Isso ocorre mais comumente durante a alimentação interrompida de grandes insetos hematófagos, especialmente da família Tabanidae. A transmissão pode também ocorrer de forma iatrogênica, porém a transmissão transplacentária, pelo colostro e/ou leite não ocorre. 

Na necropsia e na histopatologia, não são observadas alterações.

O tratamento para AIE é realizado com uma dieta rica em ferro e proteína, vitaminas e minerais essenciais. O animal deve ser poupado de esforços, deixando com que descanse o tempo recomendado pelo médico veterinário.

Os testes laboratoriais aprovados para diagnóstico da infecção pelo vírus da AIE são a imunodifusão em gel de ágar (IDGA), o ELISA competitivo (cELISA) e o 2-Mercaptoetanol (2-ME).