Em viveiro de plantas as doenças fúngicas são as de maior ocorrência, portanto de maior importância, e dividem-se em três classes. Em uma delas a doença causa manchas e crestamentos foliares, secamento de acículas, morte de ponteiros e necroses no caule. Os patógenos mais comuns são dos gêneros Cylindrocladium, Botrytis, Phytophthora, Cercospora e Puccinia psidii (ferrugem do eucalipto), sendo que o primeiro patógeno tem causado maiores problemas. 

A doença fúngica descrita denomina-se: